1944年6月，在马里亚纳大海战重出江湖的“双鹤”瞬间变“单鹤”，日军输得一塌糊涂，日本军国主义的丧钟敲响。这场大海战美军出动15艘航母，891架舰载机，日军出动9艘航母，439架舰载机。6月19日，多灾多难的“翔鹤”号航母被美军潜艇“棘鳍”号发射的4枚鱼雷击中，引发油库燃烧爆炸，沉没于雅浦岛北方海域，1272名日军官兵随舰沉入海底。同日，日军新舰“大凤”号航母也被美军潜艇鱼雷击沉，舰上660人阵亡。如同双胞胎有心灵感应，“翔鹤”号殉难，姊妹舰“瑞翔”号也首次受到重创，被美军“约克城”号、“企业”号航母舰载机炸得燃起大火，慌乱的日军舰长贝冢武男少将一度下达弃舰命令，后成功灭火，舰长又取消弃舰命令，这在日本海军航母史上还是第一次。这一仗“双鹤”未取得任何战绩，日军损失惨重，3艘航母被击沉，凸显太平洋战场美军已完全占了上风，孤独的“瑞翔”号航母时日不多了。
1944年10月世界海战史上规模空前的莱特湾大海战爆发，孤注一掷的日军开启疯狂的自杀攻击模式，“瑞翔”号航母祥瑞不在，一战身亡。此役“瑞翔”号航母作为“诱饵”小泽舰队的旗舰，不惜代价引诱美军主力舰队北上，以策应栗田舰队突入莱特湾攻击美军登陆部队。这一战美军投入17艘航母，准备彻底摧毁日军的航母力量，由于日军小泽舰队是有意“招摇过市”，很快引来美军航母编队的围攻。10月25日晨，美军太平洋舰队第58特混编队司令米切尔中将指挥的10艘航母上的舰载机，密集出动近千架次对小泽舰队展开轮番攻击，“瑞翔”号航母首当其冲身中多弹，机舱进水，舰尾下沉，艰难挺到美军战机第4波空袭时，“瑞翔”号航母已被炸得千疮百孔，最终于14时许沉没于恩加诺角东北海域，日军包括舰长在内843人死亡。此战，“瑞翔”号航母上起飞的部分舰载机加入神风自杀特攻，击沉美军“普林斯顿”号航母，这是日军航母最后的疯狂，日军参战的4艘航母全部被击沉，已起飞的舰载机均无法降落生还。此战，日本海军主力尽失，再组织不起大的海上战役行动，美、日航母对决也就未再上演。
