于是，东晋以来的权力规则开始发挥作用，四个顾命大臣废了刘义符，让刘裕的三儿子刘义隆做了皇帝。
四大臣废刘义符的行为，获得了士族的广泛支持，因为在南北朝来说，这样的行为并不似后世看得如离经叛道那么严重。当年王敦要废司马绍的太子位，在士族们眼中，也并非那么犯上，而是可以大家讨论。
可是，后继者的刘义隆比刘义符英明得多，乃“博涉经史”，因此具有相当的政治头脑。徐羡之等人扶持刘义隆做了皇帝后，立刻就“归正”刘义隆。刘义隆也不客气，爽快地接受了归正。
刘义隆虽然是徐羡之等人扶持上来的，但是他想扩大皇权，又想着被废和被杀的刘义符的下场，因此他要诛杀徐羡之等人，为了保密，他谎称要伐北魏。
徐羡之等人根本想不到刘义隆要诛杀他们。结果，刘义隆突然诛杀了近在建康的徐羡之，傅亮，还有谢晦的儿子，并准备起兵诛杀坐镇荆州的谢晦。
刘义隆的行为，实际是要打破东晋以来皇权和门阀共治的规则，将门阀权力收归皇室。
类似刘义隆的行为，在东晋初年有过相似的情况。
当晋元帝司马睿准备夺取门阀的权力时，王敦起兵，他得到了士族们的支持，因此成功打进建康，后来王敦觊觎皇权，又遭到了士族们的反对，最终失败。
现在刘义隆也要夺取门阀士族的权力，可是他没有能力和门阀谢晦抗衡，他拉上了檀道济。
刘义隆是有政治头脑的人，知道分化瓦解的策略，他找到了檀道济和另外三人的不同点，即檀道济是寒族出生。
可是，在徐、傅、谢三人看来，檀道济虽然出生寒族，可是已经获得高位进入了士族行列，因此檀道济就是门阀士族的自己人。为此，他们编排了一套和皇权分庭抗礼的战略规划：
以为上流，而檀道济镇广陵，各有强兵，足以制朝廷;羡之、亮居中秉权，可得持久。
即谢晦在荆州，檀道济在广陵，徐羡之和傅亮管理中枢，可以和皇权抗礼，继续皇权和门阀士族共治。
为此，檀道济的决定很重要，可是，他是优秀的军人，却并非优秀的政治家。
檀道济或许不清楚东晋的权利结构，又或许他不认为自己是门阀士族的一员，又或许他认为理应无条件站在皇权一边，因此他选择了刘义隆。
檀道济背叛门阀士族而选择皇权，是徐羡之、傅亮和谢晦完全没有想到的，即便徐羡之、傅亮已经被杀，谢晦依然不相信檀道济会选择皇权。直到檀道济大军来到，谢晦才恍然大悟，顿时“惶惧无计”。
双方作战以谢晦失败而告终，期间，不少士族也准备起兵支持谢晦，可惜还没有赶到谢晦就失败了。
檀道济不知道的是，他破坏了东晋以来门阀士族和皇权共治的权力平衡，而这个平衡一旦失去，他自己也将成为皇权的牺牲品，因为他本人已经是士族，他的儿子们个个有才用，麾下将领各个身经百战，假以时日，他就是继王、庾、桓、谢之后的檀氏门阀。
10年后檀道济的死，实际就是皇权和门阀士族之争的延续，只不过这个平衡被打破，皇权占据了主动和优势，檀道济只能束手就擒。
